Псевдо

27 марта 2023 г.

Эта статья была проверена в соответствии с редакционным процессом и политикой Science X. Редакторы выделили следующие атрибуты, гарантируя при этом достоверность контента:

проверенный фактами

рецензируемое издание

надежный источник

корректура

Автор: Science China Press

Недавно исследовательская группа под руководством доктора Шуньпина Хэ из Института глубоководных наук и инженерии Китайской академии наук опубликовала результаты своего исследования в онлайн-версии Science China Life Sciences.

Они сообщили о первом высококачественном геноме глубоководного угря (Ilyophis brunneus), который проливает свет на молекулярные механизмы глубоководной адаптации. Образец глубоководного угря был добыт китайским обитаемым подводным аппаратом «Шен Хай Юн Ши» на глубине 3500 метров в Марианской впадине. Исследователи идентифицировали угря как мутного стрелозубого угря (MAE) посредством морфологического наблюдения и анализа митохондриального штрих-кодирования.

Чтобы исследовать молекулярные механизмы глубоководной адаптации угря, исследователи сначала секвенировали и собрали высококачественный геном MAE, используя высокопроизводительное секвенирование Illumina, технологии PacBio и Hi-C. Затем они провели филогенетический и сравнительный геномный анализ, чтобы выяснить его происхождение и механизмы адаптации.

Исследование показало, что несколько критически важных генов, связанных с поддержанием и регуляцией цитоскелета, претерпели специфические мутации, такие как гены TUGBCP3 и ITGA, которые подверглись сильному положительному отбору. TUBGCP3 является важным компонентом комплекса γ-тубулина и играет решающую роль в зарождении микротрубочек в центросоме, тогда как ITGA способствует стабильности цитоскелета микротрубочек и регулирует сборку цитоскелета.

Исследователи также обнаружили, что большое количество семейств генов подверглось расширению, положительному отбору и быстрой эволюции, что было связано с способностью к восстановлению ДНК, текучестью мембран, нормальными процессами транскрипции и трансляции, а также энергетическим метаболизмом.

Кроме того, анализ давления отбора глубоководных угрей, европейских угрей и других мелководных видов рыб показал, что значение ω у глубоководных угрей было значительно выше, чем у других видов рыб, что позволяет предположить, что глубоководный угорь вероятно, испытал функциональную ускоренную эволюцию в экстремально глубоководной среде. Эти генетические вариации, возможно, позволили глубоководному угре развить способность адаптироваться к экстремальным глубоководным условиям.

Больше информации: Цзе Чен и др., Сборка генома псевдохромосомной длины глубоководного угря Ilyophis brunneus проливает свет на глубоководную адаптацию, Science China Life Sciences (2023). DOI: 10.1007/s11427-022-2251-8

Информация журнала:Наука Китай Науки о жизни

Предоставлено Science China Press